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更新于 11月21日
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數(shù)據(jù)/生信科學(xué)家

2.5-3.5萬
  • 合肥蜀山區(qū)
  • 經(jīng)驗不限
  • 博士
  • 全職
  • 招2人

職位描述

PythonR語言代謝組學(xué)基因測序
崗位職責(zé)：
  1. 主導(dǎo)DNA與RNA測序數(shù)據(jù)分析
  • 負(fù)責(zé) DNA和RNA測序數(shù)據(jù)的全流程分析，包括數(shù)據(jù)質(zhì)控、比對、轉(zhuǎn)錄本識別、可變剪接、結(jié)構(gòu)變異檢測及表達(dá)定量。
  • 優(yōu)化并維護(hù)分析流程（pipeline），確保結(jié)果的準(zhǔn)確性、可重復(fù)性與自動化。
  • 負(fù)責(zé)多樣本轉(zhuǎn)錄組表達(dá)矩陣構(gòu)建與標(biāo)準(zhǔn)化，為下游系統(tǒng)建模與特征提取提供高質(zhì)量輸入。
  • 具備 DNA/RNA提取、建庫或通量測序操作經(jīng)驗的候選人優(yōu)先。
  1. 代謝網(wǎng)絡(luò)建模與表征工程（Representation Engineering）
  • 基于組學(xué)數(shù)據(jù)（轉(zhuǎn)錄組、代謝組、基因組等）進(jìn)行 代謝通路重建與網(wǎng)絡(luò)建模。
  • 設(shè)計與提取網(wǎng)絡(luò)層面的特征表示（節(jié)點屬性、反應(yīng)連接、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)等），為代謝系統(tǒng)分析提供可學(xué)習(xí)的結(jié)構(gòu)化特征。
  • 參與 基因組規(guī)模代謝模型（GEM） 的構(gòu)建與驗證，與實驗團隊協(xié)作完成模型—數(shù)據(jù)雙向反饋。
  1. 多組學(xué)整合與AI輔助分析
  • 整合基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組和表觀組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，開展關(guān)聯(lián)分析與通路富集研究。
  • 參與AI/ML建模過程，包括特征選擇、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化與圖結(jié)構(gòu)特征設(shè)計（representation engineering for downstream learning）。
  • 支持代謝網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)或疾病模型的系統(tǒng)層分析與可視化。
  1. 通用數(shù)據(jù)科學(xué)與科研支持
  • 承擔(dān)常規(guī)的數(shù)據(jù)科學(xué)任務(wù)：數(shù)據(jù)清洗、統(tǒng)計分析、建模驗證與可視化。
  • 熟練使用Python（pandas、numpy、scikit-learn、matplotlib）或R（tidyverse、ggplot2）進(jìn)行數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計建模。
  • 優(yōu)化數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、腳本與分析流程，提升團隊計算效率與數(shù)據(jù)復(fù)用性。
  • 參與科研論文、項目報告及內(nèi)部技術(shù)文檔的撰寫與發(fā)表。
任職資格：
  • 博士學(xué)位，專業(yè)為生物信息學(xué)、計算生物學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)或數(shù)據(jù)科學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域。
  • 精通Python和R，熟悉主流生物信息分析工具（minimap2、StringTie2、DESeq2、Scanpy等）。
  • 具備扎實的 DNA與RNA測序數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，熟悉讀長或全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)者優(yōu)先。
  • 熟悉代謝通路數(shù)據(jù)庫與建模工具（KEGG、MetaCyc、COBRApy、BiGG Models）。
  • 理解代謝網(wǎng)絡(luò)建模和特征表征的原理，具備網(wǎng)絡(luò)或圖數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗者優(yōu)先。
  • 具備良好的科研英文寫作能力與跨學(xué)科協(xié)作精神。
加分條件：
  • 具備DNA/RNA提取與建庫操作經(jīng)驗，熟悉高通量數(shù)據(jù)流程。
  • 有代謝通路拓?fù)浞治龌蚨嘟M學(xué)整合經(jīng)驗。
  • 具備機器學(xué)習(xí)或深度學(xué)習(xí)應(yīng)用經(jīng)驗（PyTorch、scikit-learn、PyTorch Geometric或DGL）。

工作地點

蜀山區(qū)合肥綜合性國家科學(xué)中心大健康研究院

職位發(fā)布者

李瑞香/人事經(jīng)理

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公司Logo合肥綜合性國家科學(xué)中心大健康研究院
合肥綜合性國家科學(xué)中心大健康研究院是參照國家實驗室體制機制建設(shè)運行的新型研發(fā)機構(gòu)，為登記設(shè)立的安徽省事業(yè)單位法人。大健康研究院由中國科學(xué)院和安徽省共同發(fā)起建設(shè)，中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)是研究院的牽頭單位并吸引全省衛(wèi)生健康系統(tǒng)和省內(nèi)外大健康領(lǐng)域高校、科研院等創(chuàng)新力量和骨干企業(yè)參與建設(shè)。大健康研究院以滿足生命科學(xué)、人口健康、疾病防治等國家重大戰(zhàn)略需求為出發(fā)點，以“源頭創(chuàng)新、促進(jìn)雙轉(zhuǎn)”為使命，對標(biāo)國家實驗室，突出應(yīng)用導(dǎo)向，帶動基礎(chǔ)研究，發(fā)展引領(lǐng)未來的顛覆性技術(shù)及事關(guān)國家競爭和安全的核心技術(shù)。
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