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更新于 8月19日

生物信息工程師(感染NGS產(chǎn)品開(kāi)發(fā))

1.5-2萬(wàn)
  • 上海嘉定區(qū)
  • 3-5年
  • 碩士
  • 全職
  • 招1人

職位描述

R語(yǔ)言PythonNCBIShell病原微生物MNGS/TNGS
【崗位職責(zé)】
1. 參與病原微生物相關(guān)NGS檢測(cè)產(chǎn)品(包括tNGS、mNGS)開(kāi)發(fā)
全過(guò)程,包括產(chǎn)品設(shè)計(jì)、引物設(shè)計(jì)、分析流程搭建與驗(yàn)證。
2. 負(fù)責(zé)mNGS/tNGS數(shù)據(jù)的質(zhì)控、過(guò)濾、分類、比對(duì)、注釋、病原識(shí)別與豐度分析。
3. 建立和優(yōu)化高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程,編寫(xiě)可復(fù)用的pipeline和檢測(cè)報(bào)告自動(dòng)化模塊。
4. 協(xié)助開(kāi)發(fā)自動(dòng)化數(shù)據(jù)處理平臺(tái),提升產(chǎn)品交付效率與數(shù)據(jù)解讀質(zhì)量。
5. 撰寫(xiě)產(chǎn)品相關(guān)的算法文檔、驗(yàn)證報(bào)告、使用手冊(cè),配合注冊(cè)申報(bào)等合規(guī)需求。
6. 與軟件開(kāi)發(fā)、臨床注冊(cè)、試劑研發(fā)等團(tuán)隊(duì)密切配合,支持產(chǎn)品設(shè)計(jì)、迭代和問(wèn)題解決。


【崗位要求】
1. 生物信息學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、微生物學(xué)、生物技術(shù)或相關(guān)專業(yè)碩士及以上學(xué)歷。
2. 至少2年以上病原微生物NGS產(chǎn)品開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn),有實(shí)際參與tNGS(靶向捕獲)、mNGS(宏基因組測(cè)序)數(shù)據(jù)處理工作經(jīng)驗(yàn)。
3. 熟練掌握常見(jiàn)微生物數(shù)據(jù)庫(kù)(如NCBI NT/NR、RefSeq、Kraken2、MetaPhlAn等)和物種注釋工具。
4. 熟悉Linux環(huán)境,掌握Python、Shell、R 等至少一種編程語(yǔ)言,具備pipeline開(kāi)發(fā)能力。
5. 具備良好的文獻(xiàn)閱讀與技術(shù)歸納能力,能獨(dú)立完成算法設(shè)計(jì)與優(yōu)化。

工作地點(diǎn)

上海嘉定區(qū)小美科技園6號(hào)樓3樓奕檢智造

職位發(fā)布者

張賽倫/人事經(jīng)理

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公司Logo上海奕檢醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
奕檢健康,成立于2019年6月,注冊(cè)在上海市靜安區(qū)市北高新園區(qū),奕檢健康信息平臺(tái)通過(guò)整合第三方醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室、自建、共享平臺(tái)、云端鏈接奕檢自主開(kāi)發(fā)的LIMS系統(tǒng)軟件與自主開(kāi)發(fā)的服務(wù)端奕檢云APP軟件形成了安全高效優(yōu)質(zhì)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)閉環(huán)。旗下全資子公司奕檢醫(yī)學(xué),座落于千年歷史古鎮(zhèn)——南翔,與市區(qū)接壤,具離虹橋商務(wù)區(qū)僅18分鐘路程,公司在嘉定區(qū)精準(zhǔn)產(chǎn)業(yè)翔云科技園區(qū),該產(chǎn)業(yè)園聚焦精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)細(xì)分領(lǐng)域,是嘉定高性能醫(yī)療設(shè)備及精準(zhǔn)醫(yī)療產(chǎn)業(yè)三大核心集聚區(qū)之一。奕檢醫(yī)學(xué)擁有1700平米標(biāo)準(zhǔn)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室,以高通量二代測(cè)序、質(zhì)譜芯片、熒光定量PCR、數(shù)字化PCR等為主要檢測(cè),專業(yè)從事腫瘤、婦幼、感染、慢病等基因檢測(cè)服務(wù)。奕檢健康團(tuán)隊(duì)年輕富有激情、業(yè)務(wù)素養(yǎng)過(guò)硬、作風(fēng)勤奮務(wù)實(shí)、以服務(wù)臨床、幫助患者為使命。遵循“以人為本、創(chuàng)優(yōu)質(zhì)服務(wù),追求卓越、讓客戶滿意”的方針。為廣大百姓提供專業(yè)基因檢測(cè)服務(wù),為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)賦能。
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