崗位職責(zé):
1. 協(xié)助清洗與整合公共及內(nèi)部單細(xì)胞數(shù)據(jù)集,利用scGPT等基礎(chǔ)大模型構(gòu)建疾病特異性的細(xì)胞亞群圖譜,精準(zhǔn)鎖定致病關(guān)鍵細(xì)胞類型。
2. 參與開發(fā)基于大模型的“虛擬基因擾動”模塊,模擬靶點干預(yù)后的細(xì)胞狀態(tài)變化,量化疾病逆轉(zhuǎn)效應(yīng)并篩選高潛力靶點。
3. 對接cMAP/HiMap等藥物轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建“疾病特征-藥物特征”反向匹配工作流,輔助識別能逆轉(zhuǎn)疾病表型的潛在老藥新用或先導(dǎo)化合物。
任職要求:
1. 具有生物信息學(xué)、計算生物學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)或相關(guān)專業(yè)背景(碩士及以上優(yōu)先)。
2. 熟悉單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析流程(Scanpy/Seurat),了解細(xì)胞通訊分析或基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)原理。
3. 了解深度學(xué)習(xí)與大模型原理,有scGPT/Geneformer等模型微調(diào)經(jīng)驗優(yōu)先,有利用AI進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘或代碼生成的習(xí)慣。
4. 熟練Python編程,熟悉PyTorch/TensorFlow框架,具備處理大規(guī)模矩陣數(shù)據(jù)的能力。